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APP归档所需成本与效益不对称。政府APP归档工作是一项对资金投入要求高、开展周期长的工程,需要雄厚且稳定的财力支持才能取得成果。国外的APP归档项目能够成功开展的重要原因之一就是拥有可靠且多元的资金支持,如美国“LCWA项目的资金来自于政府的‘国家数字信息基础设施及保存计划’,哥伦比亚大学图书馆的网络信息采集项目则是在安德鲁·W·梅隆基金会(AndrewW.MellonFoundation)的资助下进行的”。而我国WICP项目的经费来源仅是国家图书馆馆内预算,在图书馆本身的财政压力就比较大的情况下,APP信息存档项目难以获得强而有力的资金支持。
此外,政府APP信息存档工作投入大但回报周期较长,存在成本与效益的矛盾,因而商业机构往往不愿意资助,此类项目资金主要依赖政府财政。